ESTUDO DE VARIANTES GENETICAS NOS GENES CSN1S1 E CSN3 EM FÊMEAS BUBALINAS DA RAÇA MURRAH
Búfalo. Leite. Polimorfismo. Sequenciamento. SNP
As características do leite, são controladas por vários genes, com destaque para os quatro genes da caseína, CSN1S1; CSN1S2; CSN2 e CSN3, que são responsáveis por codificar as quatro frações da referida proteína, são elas, a α-caseína que inclui α (S1) e α (S2), β e κ-caseína. O estudo de variantes genéticas nesses genes, buscam investigar alelos, inserções ou deleções, que possam refletir diretamente em características produtivas, indicando diferenças na qualidade, composição, e rendimento do leite. Com isso, o objetivo desse estudo é investigar a ocorrência de polimorfismos nos genes CSN1S1 e CSN3, em fêmeas bubalinas da raça murrah. Os genes CSN1S1 e CSN3, foram analisados em 41 búfalas da raça murrah em lactação, por meio do sequenciamento de nucleotídeos. Os pares de primes amplificaram fragmentos de 313 pb para o gene CSN1S1, e 350 pb para o gene CSN3. Um SNP foi encontrado no fragmento amplificado para o gene CSN1S1, localizado no nucleotídeo de número 2.123 da região promotora (5' UTR), na posição nt-258 (A/G), o qual não causa nenhuma alteração de aminoácido. As frequências genotípicas observadas desse SNP foram 0,59 (AA); 0,38 (AG) e 0,03 (GG), enquanto as frequências genotípicas esperadas (EHW - Equilíbrio de Hardy -Weinberg), apresentaram valores distintos, de 0,61 (AA), 0,34 (AG) e 0,05 (GG). Além disso, a heterosigosidade observada (Ho) apresentou-se maior que a heterosigosidade esperada (He) (0,3846 vs. 0,3408), sugerindo-se assim, um excesso de heterozigotos em relação ao modelo de equilíbrio de Hardy-Weinberg. Quanto ao gene CSN3, foram identificados nesse estudo, dois SNPs nt-98 e nt-102 (nucleotídeos de número 377 e 381 do éxon de número 4, do gene CSN3), presentes nos códons 33 (A C C / A T C) e 34 (AC C / AC T) do fragmento analisado, os quais correspondem aos códons 135 e 136 do peptídeo maduro, e que, uma vez traduzidos, resultam nos aminoácidos Treonina (Thr) / Isoleucina (Ile), no caso dos haplótipos ATC / ACT e Treonina / Treonina, para os haplótipos ACC / ACC. De acordo com as análises das frequências para o gene CSN3, foi possível observar 0,53 para o genótipo CC, 0,41 (CT) e 0,06 (TT). Quanto as frequências genotípicas esperadas (EHW), resultaram em valores de 0,54 (CC), 0,39 (CT) e 0,07 (TT). E mais uma vez, a heterosigosidade observada (Ho) apresentou-se maior que a heterosigosidade esperada (He) (0,4118 vs. 0,3893), sugerindo-se assim um excesso de heterozigotos em relação ao modelo de (EHW). O conhecimento de polimorfismos de genes candidatos em búfalos leiteiros sugere e fomenta estudos que objetivem estabelecer associações entre tais variantes em genes candidatos, e características de produção de leite e seus derivados, viabilizando a seleção assistida por marcadores moleculares.