ESTUDO DE VARIANTES GENETICAS NOS GENES CSN1S1 E CSN3 EM FÊMEAS BUBALINAS DE PADRÃO GENÉTICO MURRAH
Búfalo. Leite. Polimorfismo. Sequenciamento. SNP
As características do leite, são controladas por vários genes, com destaque para os quatro genes da caseína, CSN1S1; CSN1S2; CSN2 e CSN3, que são responsáveis por codificar as quatro frações da referida proteína, são elas, a α-caseína que inclui α (S1) e α (S2), β e κ-caseína. O estudo de variantes genéticas nesses genes, buscam investigar alelos, inserções ou deleções, que possam refletir diretamente em características produtivas, indicando diferenças na qualidade, composição, e rendimento do leite. Com isso, o objetivo desse estudo é investigar a ocorrência de polimorfismos nos genes CSN1S1 e CSN3, em fêmeas bubalinas da raça murrah. Os genes CSN1S1 e CSN3, foram analisados em 41 búfalas da raça murrah em lactação, por meio do sequenciamento de nucleotídeos. Os pares de primes amplificaram fragmentos de 313 pb para o gene CSN1S1, e 350 pb para o gene CSN3. Um SNP foi encontrado no fragmento amplificado para o gene CSN1S1, localizado no nucleotídeo de número 2.123 da região promotora (5' UTR), na posição nt-258 (A/G), o qual não causa nenhuma alteração de aminoácido. As frequências genotípicas observadas desse SNP foram 0,59 (AA); 0,38 (AG) e 0,03 (GG), enquanto as frequências genotípicas esperadas (EHW - Equilíbrio de Hardy -Weinberg), apresentaram valores distintos, de 0,61 (AA), 0,34 (AG) e 0,05 (GG). Além disso, a heterosigosidade observada (Ho) apresentou-se maior que a heterosigosidade esperada (He) (0,3846 vs. 0,3408), sugerindo-se assim, um excesso de heterozigotos em relação ao modelo de equilíbrio de Hardy-Weinberg. Quanto ao gene CSN3, foram identificados nesse estudo, dois SNPs nt-98 e nt-102 (nucleotídeos de número 377 e 381 do éxon de número 4, do gene CSN3), presentes nos códons 33 (A C C / A T C) e 34 (AC C / AC T) do fragmento analisado, os quais correspondem aos códons 135 e 136 do peptídeo maduro, e que, uma vez traduzidos, resultam nos aminoácidos Treonina (Thr) / Isoleucina (Ile), no caso dos haplótipos ATC / ACT e Treonina / Treonina, para os haplótipos ACC / ACC. De acordo com as análises das frequências para o gene CSN3, foi possível observar 0,53 para o genótipo CC, 0,41 (CT) e 0,06 (TT). Quanto as frequências genotípicas esperadas (EHW), resultaram em valores de 0,54 (CC), 0,39 (CT) e 0,07 (TT). E mais uma vez, a heterosigosidade observada (Ho) apresentou-se maior que a heterosigosidade esperada (He) (0,4118 vs. 0,3893), sugerindo-se assim um excesso de heterozigotos em relação ao modelo de (EHW). O conhecimento de polimorfismos de genes candidatos em búfalos leiteiros sugere e fomenta estudos que objetivem estabelecer associações entre tais variantes em genes candidatos, e características de produção de leite e seus derivados, viabilizando a seleção assistida por marcadores moleculares.