Banca de DEFESA: ARLEM SANTOS DA SILVA
Uma banca de DEFESA de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.DISCENTE : ARLEM SANTOS DA SILVA
DATA : 28/06/2024
HORA: 16:00
LOCAL: SALA B, ISARH - UFRA
TÍTULO:
CARACTERIZAÇÃO DO GENE RELACIONADO À PRODUÇÃO DE COLÁGENO TIPO 1 EM cynoscion acoupa (Lacepède, 1801)
PALAVRAS-CHAVES:
Pescada Amarela: NGS; Grude; Montagem de Genoma
PÁGINAS: 53
RESUMO:
A Cynoscion acoupa, conhecido popularmente como pescada amarela, é uma espécie da família Sciaenidae que habita águas tropicais e subtropicais e se adapta a diversas regiões, apresentando grande potencial para produção de colágeno, utilizado em grandes indústrias e, em países como a China. Desse modo, estudos de relações genéticas são importantes na caracterização da produção do colágeno nesse pescado. Assim objetiva-se caracterizar o gene relacionado a produção do grude na pescada amarela encontrada na Amazônia paraense. Foram capturados três exemplares de C. acoupa de localidades diferentes para extração do DNA, e submetidas ao sequenciamento pela platarfoma Illumina, utilizando sistema NovaSeq Sp6000. O produto do sequenciamento foi avaliado pelo programa FastQC, com parâmetros estabelecidos pelo programa. A montagem do genoma foi realizado no programa Megahit cujo a qualidade dos produtos foram verificadas no programa QUAST. Para predição dos genes, software Augustus e GOFEAT para identificar os genes presentes no genoma, e a busca pelo gene do foi realizado no banco de dados biológicos DDBJ, para procurar organismos que apresentem os genes. Assim obteve-se correlações de organismos que apresentem sequência gênica do grude da Cynoscion acoupa, para a descrição do gene da produção do colágeno da pescada amarela, com um total de 380.666.644 reads, e com o genoma composto por um total de 1.461.557 contigs, tendo N50 de 1.911 e um conteúdo Gc de 42,17 %, a predição gênica gerou um total de 262.456 resultados identificados.
MEMBROS DA BANCA:
Interno - 1210306 - FABRICIO ALMEIDA ARAUJO
Externo à Instituição - GUILHERME DAMASCENO SILVA - IFPA
Presidente - 1312697 - MARCUS DE BARROS BRAGA
Externa à Instituição - REGIANNE MACIEL DOS SANTOS CORREA - UFRA