Banca de DEFESA: ADRIA DIVA DOS SANTOS PEREIRA

Uma banca de DEFESA de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : ADRIA DIVA DOS SANTOS PEREIRA
DATA : 29/02/2024
HORA: 14:00
LOCAL: ISARH - Sala B
TÍTULO:

Desenvolvimento e caracterização de marcadores microssatélites em Salminus brasiliensis (Cuvier, 1816)

PALAVRAS-CHAVES:

SSR; Marcadores Moleculares; Sequenciamento de próxima geração.

PÁGINAS: 40
RESUMO:

Salminus brasiliensis é uma espécie endêmica do rio Paraná e Lagoa dos Patos, englobando cinco países que inclui Argentina, Bolívia, Brasil, Paraguai e Uruguai. É uma espécie de grande importância econômica e social na pesca artesanal, de subsistência e esportiva. O presente trabalho objetivou o desenvolvimento de marcadores moleculares do tipo microssatélites na espécie Salminus brasiliensis. Inicialmente, o genoma da espécie foi obtido por meio do sequenciamento de nova geração pela plataforma Illumina. A qualidade das reads foram analisadas pelo programa FastQc. A montagem de novo foi realizada pelos programas SOAPdenovo2 e SPAdes e a mineração de microssatélites realizada utilizando o programa MISA e EasySSR. Para determinação de primers foi utilizado o programa Batchprimers3. O total de reads sequenciadas, foi de 4.119.94 com comprimento de 36-100 pb e Q=39,06. Com o programa SOAPdenovo2 foi obtido um N50=731 e com SPAdes um N50=1649. Os resultados do programa MISA apontaram um total de 56.893 microssatélites, predominando os pentanucleotídeos com 63,7%, e o programa EasySSR o total de microssatélites foi de 29.098, predominando trinucleotídeos com 46,3%. Foram desenhados um total de 89 primers, dentre eles, 80 primers bem-sucedidos. Portanto, através do sequenciamento de nova geração pela plataforma Illumina foram desenvolvidos marcadores microssatélites para futuros estudos de polimorfismos genéticos em Salminus brasiliensis, onde também primers foram desenhados e testados in silico para nortear futuras pesquisas.

MEMBROS DA BANCA:
Interno - 3216540 - LEONARDO CASTELO BRANCO CARVALHO
Presidente - 1957010 - MARILIA DANYELLE NUNES RODRIGUES
Externo à Instituição - OSCAR VICTOR CARDENAS ALEGRIA - UFPA
Externa à Instituição - REGIANNE MACIEL DOS SANTOS CORREA - UFRA