Banca de QUALIFICAÇÃO: ADRIA DIVA DOS SANTOS PEREIRA

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : ADRIA DIVA DOS SANTOS PEREIRA
DATA : 04/08/2023
HORA: 16:00
LOCAL: ISARH, sala B
TÍTULO:

Desenvolvimento de marcadores microssatélites e avaliaçãofilogenéticade Salminus brasiliensis (cuvier, 1816)

PALAVRAS-CHAVES:

NGS; Filogenia; Marcadores moleculares

PÁGINAS: 25
RESUMO:

O Salminusbrasiliensis (Cuvier, 1816) é uma espécie de grande porte, apreciada nos ramos de pesca comercial e esportiva a nível nacional. Atualmente, a espécie é produzida em cativeiro para fins de acréscimos em estoques naturais na tentativa de redução de impactos antrópicos sobre suas populações, as quais estiveram em estado de vulnerabilidade nas Bacias do Paraná e do Rio da Prata. Em conservação e manejo de espécies, a utilização de ferramentas genômicas é essencial para obtenção de maior eficiência, destacando-se o uso de marcadores microssatélites os quais são muito utilizados em investigações ecológicas de genética de populações. Assim, objetiva-se desenvolver marcadores microssatélites como uma ferramenta genómica para a espécie nativa S. brasiliensis para fins de avaliação filogenética entre distintas espécies de peixe. Amostras de DNA serão submetidas ao sequenciamento de nova geração, utilizando a plataforma Illumina e os sistemas MiSeq^TMeHiSeq^TM. O produto do sequenciamento será avaliado pelo programa FastQc. Para controle de qualidade dos dados, será realizada filtragem baseada  no score de Phred mínimo de 20. A montagem do genoma será feita por meio de teste nos programas SOAPdenovo2 e SPADES e a qualidade dos contigs gerados será avaliada utilizando o software QUAST. A identificação dos marcadores microssatélites será feita por meio do programa MISA com os parâmetros de seleção de mono- a hexanucleotídeos. Para a análise filogenética, serão formados outgroups a partir de dados de todas as espécies de peixes dispostas no MicroSatellite DataBase e serão geradas árvores filogenéticas pelos métodos Maximum Likelihood, Maximum Parsimony e Neighbour Joining, utilizando o programa MEGA-X com visualização e edição gráfica no programa FigTree v.1.4. Dessa forma, espera-se obter avaliação filogenética robusta entre Salminus brasiliensis e diversas espécies de peixe a partir de marcadores microssatélites, a fim de contribuir como ferramenta para o manejo sustentável de estoques naturais da espécie em programas de conservação e manejo pesqueiro.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 1957010 - MARILIA DANYELLE NUNES RODRIGUES
Interno - 1312697 - MARCUS DE BARROS BRAGA
Externa ao Programa - 3346393 - ANA PATRICIA BARROS CORDEIRO
Externa à Instituição - REGIANNE MACIEL DOS SANTOS CORREA