Banca de QUALIFICAÇÃO: GABRIELA COSTA DUARTE RIBEIRO

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : GABRIELA COSTA DUARTE RIBEIRO
DATA : 03/12/2020
HORA: 09:00
LOCAL: Videoconferência
TÍTULO:

 

 Avaliação das diferenças genotípicas entre cepas de Corynebacterium ulcerans por meio de genômica comparativa. 

PALAVRAS-CHAVES:

Toxina da difteria. Corynebacterium ulcerans. Pangenomica. Bioinformática

PÁGINAS: 34
RESUMO:

Corynebacterium ulcerans é o agente causador de infecções zoonóticas, algumas cepas dessa espécie podem carregar a toxina da difteria em seus genomas, casos relatados de infecção respiratória e cutânea tendo como agente causador a C. ulcerans vem crescendo continuamente. Conhecer melhor a genética da bactéria é imprescindível para se obter informações como a quantidade de genes virulentos e predizer possíveis alvos vacinais. As sequências genômicas foram recuperadas do NCBI (National Center for Biotechnology Information). As sequencias passaram por predição e anotação gênica através do software Prokka para a padronização, a similaridade entre as cepas foi calculada usando o software Gegenes, as ilhas de patogenicidades foram preditas através do Gipsy e a homologia entre elas foi realizada com a ferramenta BLASTn, e no PGAP foi calculado o pangenoma. As cepas PO100/5 e a w25 obtiveram baixa porcentagem de similaridade com algumas cepas. O maior número encontrado de homologias para uma mesma ilha de patogenicidade foi de 25, sendo que das 156 ilhas de patogenicidades analisadas somente 12 não possuíam homologia com sequência alguma. Das vinte e sete cepas analisadas, nove continha a sequência do gene tox em seus genomas, dentre os quais as cepas 131001 e a 210932 obtiveram maior similaridade com o gene. O pangenoma de C. ulrerans têm um total de 5.960 genes, onde 1.295 genes fazem parte do genoma core, 1.790 do genoma acessório e 2.205 são genes específicos. Ainda há algumas análises a serem feitas para a continuação e aprofundamento do trabalho.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 059.608.546-00 - LUIS CARLOS GUIMARÃES - UFPA
Interno - 1557097 - IGOR GUERREIRO HAMOY
Externa à Instituição - ADRIANA RIBEIRO CARNEIRO FOLADOR - UFPA
Externo à Instituição - ROMMEL THIAGO JUCA RAMOS - UFPA
Externo à Instituição - SIOMAR DE CASTRO SOARES