Curso integrante do
- Programa Nacional de Cooperação Acadêmica na Amazônia (PROCAD/AMAZÔNIA)
- PJ006-2023 OFICINAS DE APERFEIÇOAMENTO EM COMPUTAÇÃO - Fase II
Coordenação
Marcus de Barros Braga
Instrutores
Dr. Marcus Braga (NPCA/UFRA Paragominas)
Dr. Rommel Ramos (NPCA/UFPA)
Dr. Igor Hamoy (ISARH/UFRA)
Dr. Leonardo Carvalho (ISARH/UFRA)
Dra. Marília Rodrigues (ISARH/UFRA)
Dr. Fabrício Araújo (NPCA/UNAMA)
Dr. Oscar Alegria (UFPA)
Período
01/04/2023 a 27/05/2023
Carga Horária
70h
Número de Vagas
100 vagas - 50 internas (UFRA)
- 50 externas (outras instituições)
Modalidade de Oferta
Não-Presencial
Público Alvo
Alunos de graduação e pós-graduação das áreas de ciências biológicas, biotecnologia, bioinformática, agrárias, computação e áreas afins.
Conhecimento Prévio
O aluno deve estar cursando pelo menos o quinto semestre de graduação e ter conhecimento de ferramentas básicas de informática e internet.
Metodologia
- O curso ocorrerá com a combinação de aulas síncronas e atividades assíncronas.
- As aulas síncronas ocorrerão aos sábados, das 15h às 18h, conforme cronograma acima. As aulas síncronas totalizarão uma carga horária de 30h.
- As atividades assíncronas ocorrerão durante a semana, no intervalo entre as aulas síncronas. As atividades assíncronas totalizarão uma carga horária de 40h.
- A carga horária total do curso será de 70h.
Material Didático
Os slides, exemplos de códigos, e-books e demais materiais didáticos serão disponibilizados em um endereço no Google Drive a ser disponibilizado no primeiro dia do curso.
Ambiente Virtual de Aprendizagem
O curso utilizará uma sala no Google Classroom para comunicação, atribuição de atividades e repositório de materiais.
Monitores para Atividades Práticas
Monitores irão apoiar as atividades práticas assíncronas durante a semana.
Cronograma das Aulas Síncronas
Abril/2022
Professor
Maio/2022
01/04
15h às 18h - Unidade I
Marília e Leonardo
06/05
15h às 18h - Unida de III
Marcus e Igor
08/04
13/05
15h às 18h - Unidade IV
Rommel e Fabrício
15/04
15h às 18h - Unidade II
Marcus e Oscar
20/05
22/04
27/05
29/04
15h às 18h - Unidade III
03/06
Conteúdo Programático
Unidade I – Introdução (Dra. Marília Rodrigues/Dr. Leonardo Carvalho)
Mundo dos organismos vivos; Dogma Central e periférico; A informação na Bioinformática; Computadores e computação; Big Data e Ciência de Dados.
Unidade II – Sequências Biológicas (Dr. Marcus Braga/Dr. Oscar Alegria)
Sequências biológicas e relações filogenéticas; Comparação de sequências (Hamming e Levenshtein); Alinhamento de sequências (local e global); Pesquisa por sequências similares em Bancos de Dados; Algoritmos BLAST e FASTA.
Unidade III – Genômica (Dr. Marcus Braga/Dr. Igor Hamoy)
Genes; Genoma procarioto; Genoma eucarioto; Genoma humano; Dados NGS;
Unidade IV – Montagem de Genomas (Dr. Rommel Ramos/Dr. Fabrício Araújo)
Montagem de genomas; Finalização e anotação de genomas.
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